縣政府站位於澎湖縣政府主建築附近，是馬公市治平路的重要轉乘點。經停此站的 4 條路線涵蓋往北寮、青螺、尖山等方向，服務需要洽公、轉乘或跨鎮往來的通勤客。若要前往馬公西側行政區或尖山、青螺一帶，這裡是主要樞紐；但班次稀疏，不如馬公總站密集，需要預先規劃行程。
實地位置
站體位在馬公市治平路，鄰近澎湖縣政府主辦公室。街道寬敞，候車亭配備簡易遮蔽。步行 3 分鐘可到馬公郵局分局；步行 5 分鐘可到馬公警分局；步行 15 分鐘可到澎湖地方法院。此地段行人與車流均不算繁重，停留候車相對安靜。
搭乘小提醒
本站 4 條路線班次較為稀少，尤其零路東線 0799 每日僅約 09:15 一班，建議出發前務必查看本頁即時班次或下載澎湖公車 App。往北寮線 0759 首班車約 12:40，返程約 13:05；尖山循環線 0767 與青螺線 0768 班次亦不密集。以上時間為 TDX 資料推估，以本頁即時動態為準。多數末班車在下午 17:00–18:00 之間收班，若要往外圍方向須更早規劃。冬季東北季風強勁時，往南環或外島班次偶有延誤。